Ultrazvučni mjerači protoka imaju mnogo vrsta prema različitim principima mjerenja, koji se mogu grubo podijeliti u sljedeće kategorije:
1. Metoda brzine širenja (metoda vremenske razlike, metoda fazne razlike i metoda frekvencijske razlike);
2. Doppler metoda;
3. Metoda korelacije;
4. Beam offset metoda itd.;
Ali najčešće korištene metode mjerenja su uglavnom dvije vrste: metoda vremenske razlike i metoda Dopplerovog efekta. U isto vrijeme, prema upotrebi različitih ultrazvučnih mjerača protoka, može se podijeliti na fiksni ultrazvučni mjerač protoka i prijenosni ultrazvučni mjerač protoka.